Trước sức mạnh khủng khiếp của siêu bão Vongfong, nhiều nơi ở Nhật Bản dân cư đã bắt đầu sơ tán. Hình ảnh phát sóng trên truyền hình Nhật Bản cho thấy cư dân Minami Daitojima (Đông Nam đảo Okinawa) đang gia cố nhà cửa chuẩn bị chống bão. Chánh văn phòng Nội các Nhật Bản Yoshihide Suga cho biết, Chính phủ Nhật Bản đã tiến hành phiên họp để ứng phó với bão.

Cơn bão với cường độ siêu mạnh dự kiến suy yếu khi di chuyển lên phía Bắc nước Nhật. Tuy nhiên, hoàn lưu cơn bão sẽ gây mưa to cho nhiều vùng trong đó có Tokyo. Bão dự kiến đổ bộ vào phía Tây Kyushu trước khi hướng đến khu vực Honsu.

Không có nhà máy điện hạt nhân nào trên đảo Okinawa nhưng có 2 nhà máy điện hạt nhân trên đảo Kyushi và đảo Shikoku hiện đang tạm dừng hoạt động. Nhà máy điện hạt nhân Fukushima Daiichi - bị ảnh hưởng nặng nề do trận động đất, sóng thần hồi năm 2011 cũng sẽ có mưa to do bão Vongfong gây ra.

Từng đợt sóng lớn ở thành phố Nanjo trên đảo Okinawa (Nhật Bản).

Đây là cơn bão lớn thứ 2 chỉ trong vòng chưa đầy 1 tuần ở xứ sở Phù Tang. Hôm 6/10, siêu bão Phanfone đã đổ bộ vào miền Trung Nhật Bản khiến 600 chuyến bay bị hủy, 1 người chết, 3 người mất tích, 20 người bị thương và 480.000 người phải đi sơ tán.